MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 3659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	ATATA	2	10	903	912	60 %	40 %	0 %	0 %	169834666
2	NC_010379	A	6	6	914	919	100 %	0 %	0 %	0 %	169834666
3	NC_010379	ATT	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834666
4	NC_010379	T	6	6	953	958	0 %	100 %	0 %	0 %	169834666
5	NC_010379	AT	3	6	959	964	50 %	50 %	0 %	0 %	169834666
6	NC_010379	TCT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834666
7	NC_010379	TGAT	2	8	1079	1086	25 %	50 %	25 %	0 %	169834641
8	NC_010379	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834641
9	NC_010379	TCTCCA	2	12	1115	1126	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	169834641
10	NC_010379	TGC	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834641
11	NC_010379	ATT	2	6	1186	1191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834641
12	NC_010379	TTC	2	6	1207	1212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834641
13	NC_010379	CTC	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834641
14	NC_010379	ATA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
15	NC_010379	CT	3	6	1712	1717	0 %	50 %	0 %	50 %	169834598
16	NC_010379	ATATT	2	10	1755	1764	40 %	60 %	0 %	0 %	169834598
17	NC_010379	TA	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
18	NC_010379	TAT	2	6	1791	1796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
19	NC_010379	TTA	2	6	1797	1802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
20	NC_010379	AAT	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
21	NC_010379	TAA	2	6	1828	1833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
22	NC_010379	TGA	2	6	1843	1848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834598
23	NC_010379	AATT	2	8	1857	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
24	NC_010379	A	6	6	1888	1893	100 %	0 %	0 %	0 %	169834598
25	NC_010379	A	6	6	1907	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	169834598
26	NC_010379	TAA	2	6	1918	1923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834598
27	NC_010379	TA	3	6	1930	1935	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
28	NC_010379	AAAT	2	8	2019	2026	75 %	25 %	0 %	0 %	169834598
29	NC_010379	AT	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	169834598
30	NC_010379	A	8	8	2069	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	169834598
31	NC_010379	ATT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834598
32	NC_010379	T	6	6	2179	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
33	NC_010379	GCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834657
34	NC_010379	TA	4	8	2229	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
35	NC_010379	TA	3	6	2280	2285	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
36	NC_010379	AT	4	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
37	NC_010379	ATG	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834657
38	NC_010379	CTTT	2	8	2349	2356	0 %	75 %	0 %	25 %	169834657
39	NC_010379	T	6	6	2360	2365	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
40	NC_010379	T	7	7	2423	2429	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
41	NC_010379	ACT	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
42	NC_010379	TA	3	6	2497	2502	50 %	50 %	0 %	0 %	169834657
43	NC_010379	AGA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834657
44	NC_010379	ATT	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
45	NC_010379	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
46	NC_010379	T	7	7	2578	2584	0 %	100 %	0 %	0 %	169834657
47	NC_010379	ATA	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834657
48	NC_010379	ATTAA	2	10	2708	2717	60 %	40 %	0 %	0 %	169834657
49	NC_010379	TTA	3	9	2738	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
50	NC_010379	CTTTTT	2	12	2760	2771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169834657
51	NC_010379	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
52	NC_010379	TATTTA	2	12	2799	2810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834657
53	NC_010379	CAT	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834657
54	NC_010379	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834681
55	NC_010379	TTA	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
56	NC_010379	TAT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
57	NC_010379	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
58	NC_010379	ATA	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
59	NC_010379	T	7	7	2958	2964	0 %	100 %	0 %	0 %	169834681
60	NC_010379	AAT	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834681
61	NC_010379	TTA	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
62	NC_010379	TCTT	2	8	2996	3003	0 %	75 %	0 %	25 %	169834681
63	NC_010379	ATT	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
64	NC_010379	TAT	3	9	3015	3023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834681
65	NC_010379	TTTA	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	169834681
66	NC_010379	AT	4	8	3068	3075	50 %	50 %	0 %	0 %	169834681
67	NC_010379	CAT	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
68	NC_010379	ATC	2	6	3241	3246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
69	NC_010379	TTTCCA	2	12	3257	3268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169834676
70	NC_010379	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834676
71	NC_010379	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834676
72	NC_010379	CTT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
73	NC_010379	TA	3	6	3379	3384	50 %	50 %	0 %	0 %	169834676
74	NC_010379	CTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
75	NC_010379	TGCT	2	8	3481	3488	0 %	50 %	25 %	25 %	169834676
76	NC_010379	TAC	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834676
77	NC_010379	TC	3	6	3521	3526	0 %	50 %	0 %	50 %	169834676
78	NC_010379	TCT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834676
79	NC_010379	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169834676
80	NC_010379	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
81	NC_010379	ATC	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834692
82	NC_010379	T	6	6	3965	3970	0 %	100 %	0 %	0 %	169834692
83	NC_010379	AGC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834692
84	NC_010379	AGT	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
85	NC_010379	GTTA	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	169834692
86	NC_010379	AAT	2	6	4185	4190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834692
87	NC_010379	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834692
88	NC_010379	ATAG	2	8	4400	4407	50 %	25 %	25 %	0 %	169834692
89	NC_010379	CTA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834692
90	NC_010379	TTA	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
91	NC_010379	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
92	NC_010379	AAG	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834692
93	NC_010379	AT	3	6	4627	4632	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
94	NC_010379	TAG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
95	NC_010379	ATA	3	9	4799	4807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834692
96	NC_010379	ATT	3	9	4841	4849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
97	NC_010379	AT	3	6	4854	4859	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
98	NC_010379	AT	3	6	4864	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
99	NC_010379	TAT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834692
100	NC_010379	TAG	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834692
101	NC_010379	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	169834692
102	NC_010379	TAC	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834615
103	NC_010379	TG	4	8	5209	5216	0 %	50 %	50 %	0 %	169834615
104	NC_010379	TA	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
105	NC_010379	AT	4	8	5243	5250	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
106	NC_010379	A	6	6	5278	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	169834615
107	NC_010379	TGT	2	6	5336	5341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834615
108	NC_010379	AGT	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834615
109	NC_010379	A	6	6	5525	5530	100 %	0 %	0 %	0 %	169834615
110	NC_010379	TTG	2	6	5551	5556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834615
111	NC_010379	TAT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
112	NC_010379	TTGC	2	8	5576	5583	0 %	50 %	25 %	25 %	169834615
113	NC_010379	ATT	2	6	5584	5589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
114	NC_010379	TTTA	2	8	5599	5606	25 %	75 %	0 %	0 %	169834615
115	NC_010379	TTC	2	6	5608	5613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834615
116	NC_010379	ATC	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834615
117	NC_010379	AGA	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834615
118	NC_010379	TAT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
119	NC_010379	ATT	2	6	5795	5800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
120	NC_010379	TTTA	2	8	5806	5813	25 %	75 %	0 %	0 %	169834615
121	NC_010379	AGA	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834615
122	NC_010379	ATT	2	6	5866	5871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
123	NC_010379	TA	3	6	5881	5886	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
124	NC_010379	TC	3	6	5891	5896	0 %	50 %	0 %	50 %	169834615
125	NC_010379	TCT	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834615
126	NC_010379	T	6	6	5938	5943	0 %	100 %	0 %	0 %	169834615
127	NC_010379	ATTA	2	8	5977	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	169834615
128	NC_010379	TAT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834615
129	NC_010379	CTG	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834615
130	NC_010379	GAT	2	6	6102	6107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834615
131	NC_010379	ATA	2	6	6144	6149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834615
132	NC_010379	GAA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834697
133	NC_010379	ATT	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834697
134	NC_010379	TAG	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834697
135	NC_010379	TAC	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834697
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137	NC_010379	AAAT	2	8	6371	6378	75 %	25 %	0 %	0 %	169834697
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